《生化危机6》的故事讲述了第五代故事发生之后的2013年,在这一年当中又发生了令人毛骨悚然的新事件,这次新事件的发生距离浣熊市事件已经是十几个年头的时间了。就在事件发生的时候,当时就职的美国总统亚当·本福德预计讲从前的阴谋和盘托出,但是就在总统即将举办演讲,讲述当年的阴谋发生始末的当天,一场充满了恐怖气氛的生化袭击在美国大规模的爆发了,总统还没有来得及演讲就在这次生化事件当中不幸的遇难了。当时那场浩劫的幸存者,同时也是遇害美国总统的私密友人名字叫做里昂·S·肯尼迪的这个人,在当时局势的威胁下,当上了丧尸的总统,美国总统就是他被迫射杀的。同一个时间,生化恐怖安全联盟的重要人物第一时间被指派到了中国,因为中国也处在生化恐怖当中,一场全球性的危机爆发了。