沉寂四年之后，救世英雄再度出山。在黑暗统治的颓废社会里，弗里曼再次为了自由挺身而出，向以布林博士为代表的暴政提出挑战。游戏的风格承延前作，剧情紧凑，节奏明快，幽默的对白时常叫人忍俊不禁，巧妙的关卡设计使战斗过程充满新奇和挑战——几乎每关都会加入一些新鲜的道具和伙伴，如汽船、重力枪、侦察车、信息素囊等。
不同特性的敌人要利用对应的武器，战斗不仅要用枪，还要用脑，在很多情况下可以节省弹药。比如对付动作敏捷的猎头蟹，最好使用撬棍；对付僵尸则最好是霰弹枪；炮塔用重力枪；狙击手用手榴弹；远方的敌人则要用弩弓来“料理”。
战斗中还要时刻观察有无可利用的东西，如地上旋转的叶片、煤气罐，这些都是对付僵尸的利器，而散落的油桶也可引起连锁大爆炸，使附近大群怪物和敌人灰飞烟灭。游戏中还增加了谜题的份量，经常要利用重力、浮力等物理特性触发机关寻找出路，使冒险的过程轻松有趣，张驰有度。游戏不仅画面逼真细腻，声效也很具临场感，不足的是枪械的模拟不够真实，几乎感觉不到后坐力，箱子等重物拿在手里也轻飘飘的毫无重感，但瑕不掩瑜，它仍不失为本年度FPS经典佳作。
第一章 进入地点
恍惚中我又看到了G-man那张如虚似幻的脸，呼唤着我继续战斗，因为我就是拯救世界文明的英雄——戈登·弗里曼……
醒来时火车已抵达17号城市，来到站台（1）感觉到紧张的气氛，护卫队员们戒备森严如临大敌，电视里布林博士仍在喋喋不休地粉饰太平。穿过候车室（2）到检票口（3），按照守卫的指示进入走廊，进入警卫室（4）遇到了黑山基地的巴尼，如今他已潜伏在护卫队里做卧底。巴尼与克莱纳博士通话后，外面响起敲门声，我连忙躲入储物间（5）。
爬梯子到二层平台，在地上找到几只木箱，将它们叠在一起跳到窗外。来到外面的天井（6）进入楼梯间，在二楼走廊遇到一名护卫队员（7），脸上挂着轻蔑的笑，把一只易拉罐丢到地上让我拾起来，现在还不能引起他们的怀疑和骚乱，我只有乖乖照做。前面又是一个检查站（8），移居的市民正在排队领取配给物品，随着人流穿出走廊来到城市街道上。由广场（9）沿街道往右走，前面是Y形叉路口，往右边避开侦察机的注意，跳上垃圾箱爬竖梯（10）到上面的平台，越过铁网跳到另一端。前面是T形路口，左边的胡同有护卫队员在盘查行人，还是走右边吧。拐过街道（11）看到两名居民在门前探头缩脑，街道的尽头站着两名护卫队员。往左进入居民楼（12），由楼梯上去看到走廊上护卫队员正在挨户搜查，进入房间听到居民们的抱怨声，穿出走廊由楼梯到三楼，跟随一名反抗队员进入房间，在他的掩护下穿出房间上到楼顶。往前出阁楼（13）沿斜坡上高层楼顶（14），左转沿楼顶的边沿走过去，沿着塔楼（15）的外围墙沿绕过去，跑到尽头找到窗口跳入房间（16），由地板上的楼梯跑下去，结果被堵截的护卫队袭击，天旋地转中听到一阵搏斗的声响……
醒来后看到一位清秀的女子，她名叫爱莉克斯，她的父亲伊莱博士曾是我在黑山研究所的同事，不过我对她似乎没什么印象。跟着她进入电梯，不久我们来到了克莱纳博士的研究室。
第二章 “好日子”
克莱纳博士正在埋头寻找他的宠物，接着他打算利用刚研制完成的时空转输机将我送到伊莱博士那里。不久巴尼也赶来了，他在里间找到了克莱纳的宠物拉玛，原来这只所谓的“猫”是猎头蟹改造的调皮家伙，没有一点温顺的样子。穿上防护衣跑到屋角用能量插座补充能量，随后克莱纳打开传输机实验室的大门，走到右边的插座旁待命。爱莉克斯在传输机里准备传送，帮她将掉落的插头插好，然后扳动右边的开关，爱莉克斯顺利地传送到了伊莱的实验室。然而我在传送时被拉玛搞坏了仪器，结果几度被送到错误的空间，看到咆哮的鱼龙、办公室里的布林、焦灼等待的爱莉克斯等，最后回到了联合军护卫队控制的区域，我要靠自己沿着河道前往伊莱博士那里。
开始时位于电厂的平台（1）上，跳落地面进入围栏找到楼梯（2）上去，穿出铁门来到胡同，这时巴尼出现在屋顶（3），丢给我一根撬棍后离去。拿起撬棍打碎栅栏（4），下楼梯穿出走廊来到火车站的天桥。由断裂的天桥跳到地面，往左跳上第一辆列车的车厢（5），打碎木箱穿出去。这时有一辆火车呼啸而来，快速跑到车厢间隙（6）躲避，跳上第三辆列车的车厢（7），由竖梯爬到车厢顶部，跳到第四辆车厢上，纵身跃过铁网离开火车站。
第三章 运河航道
沿着幽暗的走廊下阶梯，前方看到两名护卫队员在袭击一对夫妇（1）。我用撬棍将护卫队员杀死拿到手枪，沿楼梯（2）上去杀掉一名敌人，右转又是一段楼梯（3），杀掉护卫队员来到天台，穿出铁丝网可看到下面的铁轨，站到铁梯的缓步台（4）上，跳到车厢顶部再跳到对面的平台（5），这时身后会有五名追兵，用手枪射杀后跳回去搜集子弹。用撬棍破坏屋门的木板，在废屋里射爆一架侦察机，穿出去到院落（6），这时平台（7）上出现三名敌兵，引爆油桶炸死他们。然后往左绕过去找到一处弯曲破损的铁丝网（8），跳过去会受到来自对面平台（9）敌人的袭击，射杀五六名敌人后进入胡同，在标志有“入”的地方找到一条通道（10），钻进去来到铁网另一边，对面又有一处敌人的伏击点（11），跑到通道尽头由铁网的缺口跳到铁路轨道（12）上。躲开呼啸飞驰的列车，沿通道前行右转看到敌人将油桶推了下来，迅速后退避开，透过玻璃窗射杀值班室（13）里的两名敌人。进屋看到铁路对面跳下来几名护卫队员，杀掉后沿通道往前走找到楼梯，上去过天桥横越铁轨，这时铁路（14）上出现两名追兵，射杀他们后用撬棍打碎木箱进入对面的楼梯间（15）。下楼梯来到平台，跳到铁路通道里射杀三名守候的护卫队员（16），在右侧（17）找到弹药和电池等补给。往右跳入河道游到尽头，在一辆废车厢的左侧找到竖梯爬上去，由天窗跳入车厢里找到接应的反抗军（18），一名弗地岗人为防护服补充能量。
穿出车厢沿河道继续前行，用撬棍破除几道木板和横栅栏，在前面看到桥顶吸附的藤壶怪，垂下来的绳状舌头待物而噬。对付它的方法很简单，在附近拾取杂物（如箱子、易拉罐、石头等）扔过去，怪物会将它们吸起吞噬，趁机穿行过去。从瓦砾堆里爬出去，看到右侧管道（19）里的反抗军被护卫队击毙，往右转射杀河道里的护卫队员和上方机枪手，在旁边的墙壁找到管道入口，由此进入反抗军避居所。拾取补给后由竖梯爬上去控制机枪（20），这时敌人开始发动攻袭，护卫队员蜂拥而至，空中还有侦察机飞来扫射，用重机枪将敌人全歼后结束战斗。
第四章 水障碍区
汽船穿出隧道后左转，不远处有一处障碍（1），要沿着斜搭的木板飞过去，往右转抵达一座水池（2）前，这里有个谜题要解决。水池上方是个弯曲的木板，俨然是一根很好的翘板，现在还不能使用。先跳下汽船钻入旁边的管道到达水池上方，将里面的两只塑料桶推落到水池里，跑入水池潜到木板的底部找到一只铁笼，将水面的三只塑料桶全部放到水下的笼子里，这样上方的翘板就翘了起来。返回汽船由翘板飞跃到对面，沿河道飞驶过去途中（3）会遇到护卫队员的袭击，不用理会他们直接冲过去。前方有一道沟堑（4），靠左墙的斜坡前飞越过去，沿途的敌人用汽船撞死。遇到第二道闸门跳下汽船，由竖梯爬上平台（5）进入屋里，往前到车库射杀一群护卫队员和几只飞锯，旁边两间屋子里可补充装备。穿出房间来到庭院（6），射杀对面的机枪手，穿过庭院进到对面的屋子，杀掉里面的两名敌人，推门来到外面的平台，发现控制闸门的阀门坏掉了，注意观察空中的吊车，木架上的缆绳上吊着一捆铁料（7），将支架下面的油桶射爆，吊车缆绳上的铁料像巨锤一样砸向闸门，闸门瞬间被毁坏。巨大的响声触发警报，迅速抽身回到庭院，控制重机枪扫杀涌来的敌兵，清除完毕回到汽船沿河道继续飞驶。穿过闸门左转遇到水坝桥梁（8）上枪手的扫射，岸边装甲车发射的飞弹也密集攻来，驾驶汽船划着曲线躲避。冲过水坝后是一段弯曲的河道（9），沿途出现更多枪手，冲过去后前面是座双洞桥（10），敌人在桥前燃起一道火墙，从右侧的斜坡冲过去，下一座桥（11）直接由桥洞穿行，这里敌人火力相对密集，因此动作要快。
沿水道前行找到两只吊篮（12），将吊篮里的铁块取下，降下另一只，从里面拿到急救包和弹药。往前行驶遇到第三道水闸，旁边是一个码头（13），靠岸跳下汽船，打坏门锁进入房间（14），射杀几名护卫队员穿出房间，上楼梯来到天台的货场（15），这时不仅要应付集装箱之间的敌人，还要躲开空中猎捕直升机的扫射。穿过货场进入仓库（16），清除敌人后往右上平台，由三只集装箱跳到左边平台上，上楼梯到二层，再下楼梯到达外面的货场（17），进入控制室（18）打开水闸大门。回到汽船穿过闸门，这时空中的直升机会扫射并投掷炸弹，注意等炸弹自爆后再穿行过去。正前方的路被废船阻住，往右转开到水坝，利用水坝（19）的斜坡飞到相邻道水域（20），穿出一段隧道（21）是开阔的水面，沿着河流蜿蜒直上，在尽头是一连串的水管（22），穿过去有一段要沿水管顶部开过去，然后飞落到前方的管道（23）中。穿出管道往右转看到阶梯（24），沿左侧搭着的两根木柱开上去，飞落到前面的通道中。穿过开启的闸门（25）进入河道，往前穿过隧道是狭窄的河渠（26），进入主河道穿过几道桥梁（27），前方桥梁下的河道被一艘废船阻住，沿右侧的斜坡冲上去，飞跃到对面的平台上，旁边的大房子是船只修理厂（28），进去可找到生命和电力恢复点。将汽船停放到升降梯上，放到水中，跳上汽船沿主河道继续飞驶，穿过隧道（29）跳下汽船，这里要解决一个谜题。
前方的通道被隔断了，在左侧有一部起重机（30），先扳动地上的拉杆，回身由墙壁爬上竖梯跳上管道顶部，沿木桥走到墙边的雨蓬上，跳上前面的平台将旧洗衣机推下去落在吊篮里面，这样左边的吊架被升起来，上面的木板搭成斜坡，驾驶汽船沿斜坡冲上去跃过前方的障碍，沿河道进入山洞遇到接应的反抗军（31），进屋子里听他们照地图解说计划，那名弗地岗人将机枪组装在了汽船上。跳上汽船冲出山洞进入河道，射跑一架直升机后从一座铁轨桥底（32）穿过去，跳过斜坡往右转进入闸门，敌人将前后两道闸门（33）全部封闭想要瓮中捉鳖时，冲上右侧的平台跃入前方河道。避开飞弹往前看到隧道（34），等滚落的油桶爆掉再进去。在隧道两侧平台有很多敌人，远处射杀后再通过。穿出隧道落到河道，桥上的装甲车（35）可拦截飞弹将它炸掉。在穿过一连串的隧道后来到水坝（36），上面会滚落油桶，小心地避开它们射杀顶部的敌人，利用斜坡的冲力进入相邻的河道。往前来到一处港湾（37），这里有几只废弃的旧船，先将上面的两辆装甲车摧毁，在尽头找到一个红色的集装箱，射爆里面的油桶将后门炸开，穿过集装箱沿着通道逆时针开过去，冲上斜坡跃入墙壁里的管道。
穿出通道进入开阔的河滩地带（38），在这里会受到一架猎捕直升机攻击。躲避投掷的炸弹，趁它飞近时用重机枪扫射直至摧毁。往前找到一道闸门（39），爬上岗亭用阀门将闸门打开，冲上斜坡绕过建筑过桥，在平台上跳下去找到阀门（40）打开水坝的闸门，这时河滩的水位上升，驾驶汽船返回去，由几根木头飞跃闸门里，通过水坝。
第五章 黑山基地东区
弃船上岸，沿平台绕到建筑的后面找到基地入口，在进行扫描时听到莫斯曼博士惊讶的语气，看来她很高兴与我共事。穿过气密舱跟着她进入电梯，一路上她聊起时空传送研究的进展情况。见到伊莱博士后爱莉克斯出现，她和莫斯曼打起嘴仗来，看来她俩的关系有点紧张。伊莱见状连忙解围，让爱莉克斯带我去试用重力枪。
来到废料场掌握重力枪的使用方法，按鼠标右键抓取（吸附）物体，再按左键可投掷出去。先将架子上的铁桶吸下来，再搬几只箱子叠在架子下爬上去。再次找到爱莉克斯，她唤出一只叫“阿狗”的机械狗玩游戏，它不断地朝我扔木箱，这时敌人的侦察机出现，我们连忙进入气密舱回实验室，伊莱博士叫我们朝海边逃，爱莉克斯坚持去找父亲，我只好在阿狗的护送下前往基地出口。沿通道找到一道竖井，打碎竖梯上的铁锁由梯子爬上去。
第六章 “我们不去莱温霍姆……”
要前往海滩需要穿过莱温霍姆镇，这里僵尸密布，还有敏捷的猎头蟹出没，由于没有护卫队员出现，弹药也相对紧张，因此要擅于利用场景中的道具来消灭怪物，这些怪物都怕火，可引爆油桶，还有煤气罐可燃起火墙。
由起始的竖梯（1）爬到莱温霍姆镇，穿出走廊来到院落（2），用撬棍破门进入房间（3）遇到几只僵尸，引爆油桶将它们炸死。到后院的胡同有一个旋转叶片（4），它会将靠近的僵尸裂成碎片，蹲下身关掉它，过去。上楼梯穿过房间（5）和（6），开启地上的旋转叶片将僵尸消灭。进入胡同看到大楼前（7）燃起熊熊大火，成堆的僵尸被焚烧，窗口有一名叫葛利高力的神父正在射杀下面的怪物。神父离开后跑上台阶将煤气罐关掉熄灭火堆，进入楼里上梯子跳到平台上扳动窗旁的电闸（8）。回到街道走到胡同口（9）关掉煤气罐消除火墙，进去引僵尸出来再燃火墙烧死它们。爬竖梯翻过栅门（10，如没有关闭电闸，栅门会带电），爬梯子跳到顶部平台（11），再跳到对面楼上的平台（12），走到尽头看到空中木板搭成的栈桥，沿着它由窗户跳入楼（13），跳到底层穿出房间（14），胡同里有不少僵尸缓慢走过来，在（15）和（16）的位置各有一架起重机，扳开关将轿车吊起来，等僵尸走到下面将轿车落下，清除僵尸。经由轿车和木板搭成的空中栈桥到达胡同尽头的窗口，跳入房间（17），穿过狭长的走廊，由房间（18）的窗户跳到外面平台，这时会走过来几只僵尸，对面楼顶的神父开枪将其杀掉。俯瞰下方的街道（19）有一些怪物在游荡，射击下面的油桶引起连锁爆炸，将街面的僵尸和猎头蟹清除干净。
跳落到街道，引爆油桶炸开栅门进入密室（20）拿急救包，再由竖梯（21）爬到空中铁轨进入楼（22），在三张床上拿急救包，不久会有六只僵尸爬上楼梯，消灭后下楼绕一圈，由后门来到院落（23），往前进入楼房（24），杀到楼顶天台看到神父在楼房（25）的阳台出现，扔过来一把霰弹枪和一盒弹药。由楼顶往下看，在铁路对面有一个圆形蓄水罐（26），纵身跃入蓄水罐，爬竖梯到脚手架，再爬到楼顶平台（27）。杀掉一群怪物，推门进入屋里乘电梯（28）下去，在街道（29）杀掉几只猎头蟹，由轿车上的木板跃入铁网进入院落（30），转过铁网到房间（31）拿补给。往前来到街道（32），这片居民区的僵尸是杀不尽的，会有两只僵尸不断再生。先清除街道上的僵尸，然后由（33） 处上楼，扳动拉杆将吊架移到街道的中心（34），再跑到（35）处爬到屋顶，跳到旁边的平台（36），接下来要经由民居的屋顶走到街道的尽头，顺序是（37）、（38）、（39）、（34）、（40）、（41）、（42）、（43），在屋顶（43）会再次看到神父拔枪相助。跳到楼房（31）的顶层，进入房间（44）遇到10余只僵尸，房间里有很多煤气罐，用重力枪吸取并投掷出去，有手榴弹一样的效用。下楼梯后右转，爬梯子上屋顶平台（45），再由木板走到屋顶（46）上面，沿平台左转跳到相邻的屋顶（47），跳落地面穿过走廊绕到庭院（48），上平台由楼梯一直跑过去进入楼（49），爬到楼顶看到对面教堂的神父，他会将一辆缆车送过来，在这段时间会陆续有僵尸跑上来攻击。跳上缆车来到神父身边，从桌子上拿取装备，然后跟着他前往墓地杀僵尸，这里的战斗很激烈，僵尸会源源不断从四周涌现。跟随神父移动位置，让他冲在前面尽量节省子弹，只消灭近身的家伙，在后期的场景有很多油桶要好好利用，用来轰炸成群的僵尸。将所有僵尸清除后神父打开了大门，跑进楼里找到一道竖井，这里要小心地由四周木梁跳下去，稍有闪失便会丧命。落身到平台（50）后先到小屋（51）里拿装备，然后跳落地面快速跑到另一段楼梯和平台（52），地面上猎头蟹密布，不要被咬到。沿平台跑到尽头由横梁爬进去，落身到一条坑道里面，跑到末端纵身跳入地上的水井（53），浮出水面由缺口游入水洞（54）。
游上来是一个矿洞，往前扳动开关启动轨道上的矿车（55），它会往复飞驰将赶来的僵尸杀掉，同样也会伤到自己。在沿途有三处藏身之处，算好时间往前移动，最后跑出洞口来到火车站区域。沿轨道前行打碎箱子拿到手榴弹，要用它来解决两名狙击手。前方的天桥上有名狙击手在朝猎头蟹射击，由天桥下将手榴弹扔进窗口炸死他。另一名狙击手在远处的天桥上，先跑到车厢后藏身，再跳到右侧平台，继续往前躲到平板车后面，蹲着由车底过去跳进红色车厢，里面还有几枚手榴弹，由车厢扔到天桥的窗户里将他解决。然后往前杀掉两名护卫队员抢到脉冲枪，清除停车场的敌人，进入修理车间看到反抗军正在与护卫队交火，协助他们将护卫队歼灭，跟随黎恩到屋里与爱莉克斯通话，得知伊莱和莫斯曼被护卫队抓走并带往诺瓦矿场，下面的任务就是由海滨公路前往矿场解救博士。
第七章 17号公路
推门出去来到港口的通道，侦察车已准备好了，上面安装了T型粒子炮。跳到车里磁铁起重机开始将我升起，准备吊到公路上面，结果半途磁铁失灵，我重重地摔在了沙滩上，立即遭到了蚁狮的疯狂袭击。马上退出车子躲避，通道上的黎恩会用机枪清除它们。我手中换上重力枪，把车子翻过来，跳进车里开始疾驶。爬上山坡有一处断桥，加速（左Shift）飞过去，再往右爬一段高坡来到隧道口，在木屋前拾取弹药和急救包。穿出隧道前方是断崖，由右侧的陡坡到沙滩，这里会受到蚁狮的攻击，用车上的粒子炮射杀。往前上沙丘抵达第一间小屋前，附近的声波驱逐器对蚁狮有防御功能，将车辆停放在它旁边。进入小屋地下室杀掉几只猎头蟹收集装备，回到车上由栅栏缺口冲过去下斜坡，沿沙滩继续前行，在沙丘上找到第二间屋子，消灭里面的三名护卫队员，用窗口的望远镜观察远处河岸的状况。沿沙滩继续走找到第三间屋子，外面的护卫队员正在与蚁狮交火，用车上的粒子炮杀掉他们，进入仓库拿取手榴弹和急救包。
沿沙滩继续走，看到河岸的反抗军基地，看到驱逐器后往左开上斜坡，在基地里见到给反抗队员上课的卡伯居上校，从他手上拿到火箭，推进榴弹炮。不久警报响起，敌人的直升机来袭，扛上榴弹炮跑出去轰炸直升机，8～10枚榴弹可将它击毁，完成后到四处搜索弹药，然后进屋里找上校谈话，再上车由打开的大门上公路飞驶。穿越一片峡谷地带再次进入沙滩区域，不要开进深水区，小心沿海岸行进，抵达码头，一群蚁狮正在围攻护卫队，这里可让他们互相残杀，等死伤差不多再去收拾战场。把车停放在驱逐器（1）旁，由木板斜坡上去杀两名敌人，爬竖梯到平台，爬上起重机的塔楼（2）操纵磁铁将侦察车放到后面的平台（3）。操作步骤和使用重力枪一样，只是注意要让磁铁的阴影投在车上。放下车辆后，从修车厂里冲出来三名敌人，杀掉他们再用吊车的磁铁将吊桥撞倒。
过桥后驾车驶入修理厂（4），跳下车到控制室扳拉杆打开卷帘门，驾车穿出修理厂到后方院落，消灭几名敌人收集补给，厂房（5）的窗户上有木栅，先用车撞碎它，再直接加速飞出去落到公路（6）上。这时有一架直升机飞袭，先不理会它，跳过断桥（7），在转弯处是交通事故的现场（8），跳下车辆从一辆车里拿到榴弹，用榴弹炮将直升机炸毁，然后用重力枪将废车推落悬崖，清除障碍后离开这里。穿过隧道在途中（9）会遇到蓝色带电的滚雷，小心地避开它们，如果它们吸附在车上，跳下车用重力枪吸过来扔到崖底。驶到几幢房屋（10）前遇到山崩，下车消灭敌人进入屋里搜索装备，到楼上从窗户消灭外面冲来的敌人。开车抵达一座桥梁前，这里有几辆失事的车辆，跑到右侧的山丘（11）上拿到弓弩。冲到桥的另一端，车辆被一道电磁屏障（12）阻拦，跳下车清除桥头的敌人，注意末端电线杆的电线连在一辆装甲车（13）上，用重力枪将装甲车推开，电源切断屏障消失。乘车穿过隧道看到远处的大桥（14），桥上有电磁屏障（15）不能通过，先到桥底的几幢房屋前（16）清除敌人和怪物，从箱子里拿到榴弹。进入废屋（17），由裂开的地板跳到下面的石径，消灭几只猎头蟹后沿石径进入桥底的房间，沿桥底通道来到第三个房间，箱子里还有榴弹。前面的天桥断掉了，要从桥架的钢梁上走过去，到达中央的平台，对面屋子里会有敌人扫射，由于距离远，枪的命中率较低，用弓弩射杀他们。到达大桥末端的房间后一直杀到顶楼，在屋子里有道电磁屏障，用重力枪将里面的插头打掉，屏障消失。进去按动墙上的按钮关闭桥上的电磁屏障，这时听到直升机隆隆声，到楼下的平台上用榴弹炮将它炸毁，榴弹不够的话按原路跑回到早先的屋子拿取。
按原路跳回去，由桥底返回废屋，路上会受到蚁狮和护卫队员的袭击，消灭后乘侦察车冲上大桥，沿桥行驶会听到火车的鸣笛声，这时迅速后退，停靠在左侧的轨道上，等火车驶过再继续前行。行驶到大桥的另一端，往左边冲下山坡沿断裂的桥梁进入隧道中。
第八章 沙地陷阱
沿着幽暗的隧道前行，在一堆废弃车辆前停下，到右边平台找到一个窗口爬进房间（1），杀猎头蟹拾取地上的补给，回到外面遇到大群僵尸涌来，跳上侦察车用粒子炮消灭它们，然后用重力枪将阻住道路的废车推到两侧，开出隧道沿高速公路疾驶，绕过橫在路上的废车（2），前方右侧有一幢楼房，杀掉外面的士兵，由楼后的墙洞进去，爬到顶楼换上重力枪将滚雷扔出去，在桌上拿到弓弩和急救包，在楼里其它层还有补给可拿。继续沿公路行驶，绕过弯道遇到一处据点（4），跳下车用重力枪先清理跳出来的滚雷，射杀大门两侧岗楼的哨兵，进入房间拿补给。穿过前方有断裂的路面（5），由左侧的石块绕过去。前方又是一处敌人据点（6），驾车由右侧斜坡绕过失事的油罐车，用粒子炮消灭敌人，战斗期间还会遇到滚雷。据点另一边的大门需要电力才能打开，在屋子里有三个蓄电池的卡座，上面已有一块电池，这时要找到另外的电池。在附近可找到三块：一块在院子里一辆灰色轿车里，一块在风车上的木台上（用榴弹炮炸下来），另一块在一个倒扣的浴缸下面（用重力枪翻过来）。将三块电池放到卡座里打开大门。穿出隧道后进入海滨的反抗军基地（7），听他们说敌人正在四处寻找我的车辆，把车开进车库里。而后敌人来袭，他们每四人一组，共有五组，杀完后跑到悬崖边爬上灯塔（8）拿榴弹，跑上天台用榴弹炮对付空中直升机，将它炸毁后和反抗军队员谈话，来到灯塔底部出去，沿着狭窄的悬崖石径跳过去。
穿出山洞进入石谷遇到困在沙地里的两名反抗军队员，站到石头上等蚁狮出现后射杀它们，继续走仍有沙地，踏在上面会引出蚁狮，这里要尽量由石头跳跃过去，站到木箱或木板上。来到海滩的岩石地带，跳到中央的大石块，往左跳到下面的石头沿木梁走到顶部，看到前方有块翘板，跳上去用重力枪将附近的箱子和铁块放到翘板末端，利用它跳到对面的高崖。如果要到小屋里拿补给，需将木桥上的箱子扔下去，用箱子和木板跳回石崖。往前跳落到下面的石径上，沙地里有门板和箱板各一块，用重力枪更替吸附它们放在脚前，穿过沙滩要铺10多次。抵达木桥进屋子拿装备，然后往前跳上石台进入木屋，屋后有辆供电车，打开它开启驱逐器，这样可安全跑到石径攀到山脊上。越过山脊前方是一个山谷，下面是空旷的沙地，跳到沙地上开始战斗。除了一些蚁狮外，还有一只巨大强悍的蚁狮卫兵，将它引到反抗军机枪射击范围内，不断地移动引爆附近离散的油桶来炸它，或者跳到岩石上用重力枪吸附油桶朝它投掷。将蚁狮卫兵杀死后，一名弗地岗人打开铁门，拾起地上的信息素囊，跟着他进入石谷的底部开始学习使用新的武器。将身上的信息素囊扔到下面的沙坑里，吸引附近的蚁狮吞食，然后将另一枚投到假人旁，蚁狮会扑上前去撕咬。学习完成后带着受控制的蚁狮进入洞穴，穿出去来到海滩，关掉沿途所有的驱逐器带蚁狮通行。不久遇到几名敌兵，指挥蚁狮咬死他们，如果蚁狮被杀掉，再往地上扔信息素囊吸引新的蚁狮受控。在海滩上有很多碉堡，里面有机枪手朝外扫射，乱石中间也埋伏着大量士兵，这里应付的策略是利用岩石的掩护用快跑闪过去，对埋伏的士兵则引诱蚁狮来消灭。利用岩石的掩护上斜坡，绕到碉堡防御线的后面找到建筑入口，里面是一大片房间，消灭空中的飞锯和埋伏的敌兵，穿出房间来到山崖石路，杀掉远处碉堡（第二座）的枪手潜入碉堡，这时有敌人的运输机出现，大群敌兵朝这边涌过来，控制机枪朝下面扫射，清除后跑下去沿山崖走独木桥跳到对面山崖上，上去看到篝火，杀掉山洞里的两只僵尸。在它们睡觉位置的上方有木栅，用撬棍打断支柱，它会落下来形成梯子，沿着弯曲狭窄的石径走上去，召唤蚁狮杀掉上方的敌兵，找竖梯爬上平台，越过平台跳到旁边的石台上，沿石台一直攀上去进入排水管道。由水池（9）爬竖梯潜入城堡，沿左侧墙壁跑过去，在墙边有三座警戒塔（10、11、12），往塔底投掷信息素囊，蚁狮会从围墙外飞进来，攻击塔上的敌兵，依法施为将几座塔楼上的敌人杀光。上阶梯进入院落（13），由窗口射杀房间（14）里的敌人，前后阳台的敌人用蚁狮来对付。绕到楼后会有直升机出现，先让蚁狮收拾高处的敌人，跑上台阶找到箱子（15）拿榴弹，炸掉两架直升机后楼（16）会炸出一个墙洞。进入楼里关闭阀门将火墙灭掉，由管道底钻过去关第二只阀门，进入下一房间听到蚁狮的掘洞声……
第九章 诺瓦矿场
由开始的房间（1）推门来到牢房区（2），下楼梯到地下牢房找到墙洞（3）进入警卫室（4），来到走廊看到炮塔正在攻击蚁狮，用重力枪将炮塔摔毁，这样蚁狮就可在监狱通行了。往前到楼梯间（5）回到一层，在警卫室（6）的墙上找到生命和电力恢复点，监视器可看到监狱各处的警卫情况。由楼梯间（7）到二楼，往前在通道（9）摧毁两座炮塔，进入它们保护的大门，里面是有水池的房间（10），跳入水中游到对面的平台（11），沿通道进入炸掉天花板的房间（12），沿着堆积的水泥板跳到二楼，往前来到牢房区（13），这里会遇到四只猎头蟹。前方的道路被封闭，由炸坏的地板一直跳到一层。出去来到大厅（14），在平台（15）有两座炮塔，投掷手雷将它们炸掉，由楼梯上到顶层沿着走廊穿出去。来到房间（16）拿补给，将堵住走廊的箱子打碎，跑到尽头越过栏杆跳到大厅（17），在这里遇到第二只蚁狮卫兵，边退边战，不断用重力枪吸附油桶等物朝它投掷，身上有手榴弹或榴弹的话也拿出来使用，将它炸死后牢房各处的地洞会陆续跳出蚁狮，成为后面战斗的好帮手。
进入走廊（18）展开战斗，专心用霰弹枪对付空中的飞锯，蚁狮则是护卫队员的克星。来到牢房区的走廊（19），控制室（20）有一道电磁屏障，用重力枪将墙上的插头打掉消除屏障，进屋将墙上的开关拉下来，打开走廊的铁门。上楼（21）进入警卫室（22），用墙上的开关打开另一道栅门（23），和蚁狮一起进入走廊（24），将炮塔和士兵全部清除后，用重力枪将墙边的栅门移开，打碎盖板进入通风道，由此爬入排风室（25），用重力枪拾取屋里的杂物，如铁锹、木板、水桶等卡住巨大风扇的叶片，这样就可从风扇间隙爬过去了。来到走廊（26）射杀敌人，用重力枪将两座炮塔摧毁，将墙上的插头拔下来消除电磁屏障，这时蚁狮可以会合过来了。而后上楼梯进入牢房区（27）展开战斗，开枪射杀远处平台上的机枪手，走廊地上有激光探测器，蚁狮会前赴后继引爆它们，冲到前面走廊用手榴弹炸毁两座炮塔，进入附近的走廊清除机枪手和炮塔，由楼梯一直杀到四层平台找到控制室（28），在墙上找到生命和电力的恢复点，从窗户可看到敌人的增援部队赶来，派蚁狮去应付他们。在房间墙上按动开关，原路返回找到打开的铁栅门（29），进入走廊（30）遭遇几名敌兵，派蚁狮杀掉。往前面的走廊（31）有两座炮塔，用手榴弹炸掉。进入洗衣房大厅（32），这里的战斗仍然派蚁狮当主力，用弓弩射杀较远一些的枪手。由竖梯上平台进入厨房（33），这里有三座炮塔，在这里蚁狮会破坏煤气管道引起大火，穿出厨房上楼梯进入警卫室（34）拿补给，用墙上的恢复点补满生命。由警卫室破碎的窗口跳到大厅（35），在这里再次遭遇强悍的蚁狮卫兵，将它杀死后由大厅的一侧找到杂乱的通道（36），这时前后的路会被封死，往左攀上平台找到出路，从尽头的竖井跳下去。
第十章 牵连设备
由坑道爬出去是一条铁路线，在这里看到爱莉克斯的身影一晃而过，顺着铁路线往前走找到她，得知伊莱博士可能被关在封锁区某处，跟随着她跑进建筑，上电梯（1）进入走廊（2）开始战斗。杀掉三名敌人后，爱莉克斯到房间（3）进入基地的安全系统查找伊莱的位置，然后消除走廊的电磁屏障（4），跟着她上楼梯（5），在走廊（6）杀掉五名敌人进入房间（7），爱莉克斯利用电脑找到密封舱里的伊莱博士，打算利用克莱纳的传送门救他出去，可是目前传送门还没修好。
回到走廊（6）爱莉克斯离开，接下来要单独行动，不过会收到爱莉克斯的通话提示，并用敌人的安全系统来帮助通过这片封锁区。出门下阶梯，在左侧房间（8）杀掉两只猎头蟹拿到弹药，穿出走廊爱莉克斯会用电脑打开大门（9），走廊另一端的大门（10）却打不开，这时按她的指点到警卫室（11），打碎架子在后面找到排风通道（12），钻进去遇到三只猎头蟹。爬出排风道来到大厅（13），这里有激光探测器，小心朝一侧跳跃过去，杀掉猎头蟹后往前走，爱莉克斯打开门（14），马上进入警卫室（15），从箱子里拿到手榴弹。这时监视器里出现爱莉克斯切换的画面，有四名敌人潜行过来，投掷手榴弹将他们炸死。用手榴弹炸毁走廊（16、17）的炮塔和机枪手，对于通道（18）的屏障需要往房间（19）里投掷手榴弹将插头炸掉，使电磁屏障消除。走廊（20）拐角里的炮塔可用重力枪把它摔坏，远处的仍用手榴弹来炸。上楼梯进入大厅警卫室（21），马上按柜子上的红色按钮，里面有两座炮塔，将它们安置在大厅的两侧角落，不久爱莉克斯会启动炮塔程序，它们开始自动防御，扫射由大厅两侧大门（22）进攻的敌人，在杀掉几拨敌人后用枪打掉空中的飞锯。回到警卫室，爱莉克斯从天花板的通道跳落下来，操作电脑看到莫斯曼与布林谈话的一幕，原来布林劫持了她的爱人凡斯，致使她投靠护卫队使他们成功地绑架了伊莱。
离开警卫室往大厅左侧的走廊行进，清理门前的一堆废物后推门到楼梯间（23），下到底层进入被水淹没的房间（24），水里有电不能游过去。先跳到平台一侧的铁管，再纵身跃到对面的平台，走到尽头有一段水域跳不过去，注意房间里有五只蓝色的塑料桶，用重力枪将它们移到这段水面形成一段浮桥，踏过水面到达角落的平台（25）。推门出去杀掉四只僵尸来到楼梯间（26），上到顶层进房间（27），用撬棍打碎门口的箱子，上面的铁柜落下来，再用重力枪将它推开来到走廊（28），往前进入牢房区（29），在这里找到三座炮塔，迅速将它们安置在几道电磁门附近防守，接着敌人会从各处入口进攻，将敌人清除后爱莉克斯回到了身边，我们并肩作战去追赶叛变的莫斯曼。接下来的行动爱莉克斯不会离开，她会破解电脑开启沿途的大门。在一间室验室找到莫斯曼后，开始利用传送机将伊莱博士送往克莱纳博士的实验室，不想莫斯曼做了手脚，她和博士被传送到了布林的城堡里。这时护卫团开始进攻实验室，在大门旁找到三座炮塔，将它安置在三道电磁屏障大门前，在抵御大约10分钟后，传送舱终于降了下来，我和爱莉克斯一起进去被传送到了克莱纳博士的实验室。
第十一章 反叛者
在实验室与克莱纳谈话，在与巴尼通讯时，反抗军的集结区遭到联合军的炮击，于是我带上爱莉克斯的改良宠物阿狗前往增援。由电梯竖井跳下去来到外面的街道上，这时警报响起，阿狗变得狂躁愤怒，举起一辆汽车朝敌人砸去。跑到街道尽头阿狗打开一道沉重的大门，跑进院落后它却留在外面，跳上一架敌人的直升机离开。
往左由墙洞进入房间，出去看到楼梯和电梯间都堵住了，穿出有土堆的走廊来到户外的街道，在这里有反抗军的队员加入。沿着熟悉的街道往前走，在广场有三名反抗军战士正在摧毁电视墙，交谈后加入队伍。率领反抗军队员往广场右边胡同穿行过去，出胡同被困在铁网里，将盖在地上的石棉瓦用重力枪移开，地坑里有四枚跳雷，接近的话会自动引爆。用重力枪小心吸起来再轻轻放下即可解除，或者扔到远处引爆。由地坑爬出铁网，进入房间拿补给，穿出胡同来到大街，这时有一名医疗兵加入，有队员受伤的话会自动治疗。杀掉几只猎头蟹，空中出现的侦察机会投下跳雷，用重力枪吸附它们后当手榴弹使用，消灭街上的敌兵。由街道尽头的胡同穿行到下一条街道，射杀冲过来的敌人。不要跑得太快，地上有跳雷，清除掉再继续前进。穿过大楼来到另一条街道 （也可爬到顶楼打僵尸，不过没什么奖励），清除地上的跳雷，在街道前方有一个巨大的弹坑，这里没法直接过去。进入对面的大楼，在一楼打碎箱子拿补给，由楼梯间直接上三楼杀掉里面的驻军，穿过控制室找到墙洞跳下去，再由一楼返回街道。前方有道坚固的防御墙，不宜硬拼，进入对面的大楼，杀到顶层找到炸开的地板，跳到一楼来到防御墙的里面，投手榴弹将里面的敌人炸死，墙后有恢复点。爬防御墙的竖梯，沿着平台进入左侧大楼，穿过房间找到楼梯间，一直下到底层地下室，跳到炸开的墙洞里找到通道，出去是一条隧道，这里是反抗军的补给线，接下来要率领队员清除占据在这里的敌兵。
沿隧道前行会遇到大群的飞锯（1），边退边打消灭它们，这里的战斗会很持久，将飞锯消灭后往前找到一辆阻路的油罐车（2），在驾驶室旁找到一道弯曲的铁丝网。跳到铁丝网上，再跳到驾驶室顶（难度较大，多试几次），再跃到相邻的另一侧铁笼顶部，跳到地面用枪打开铁栅门进去。穿出房间遇到护卫队（3），利用柱子的掩护前行，投手榴弹先将机枪手杀掉。附近有很多油桶也可射爆来杀伤敌人，杀到隧道尽头（4）听到另一边反抗军队员的说话声，这时要抵御出现的飞锯，不久反抗军队员用炸药炸开前方的通道。穿过炸开的小洞，隧道旁的门被锁住了。跳上油罐车（5），看到前方是一片污染水源（6），这里不能趟水过去，利用身上的重力枪吸引木辊在水面搭成浮桥，到达污水的对岸。在隧道左侧找到倾斜的几根管线，沿着它走上去找到排风道口，爬进去跳入隧道一侧的走廊（7），跑回去为队员打开铁门。
上楼梯出楼遇到炮弹轰击，猎头蟹出现，杀掉它们后进入前面的楼房（8），上楼梯打碎栅板进去，穿过起居室、餐厅（9）继续上楼梯，找到炸开的地板（10）跳下去，房间里有名反抗军正在安慰MM。出楼找到一扇门进入楼（11），上顶楼再找地板的弹洞跳下去，杀掉窗口的枪手，对面的反抗军会放下吊桥，过桥进入对面的楼（12）里，沿着漆黑的楼梯走上去会遇到一群猎头蟹，打开手电筒射杀它们，然后找到地洞一直往下跳，遇到燃烧的猎头蟹和僵尸。穿出走廊来到街道（13），解除地上的跳雷后进入相邻的楼（14）里，在里面有几名队员加入。来到平台射杀附近埋伏的枪手，用拉杆放下吊桥到对面的楼房（15）阳台，进屋里拿到大量的补给。从地洞跳到底层，穿过几个房间消灭伏兵，找楼梯上二楼，找到一条燃火的通道，里面有大量的燃烧僵尸，杀到尽头跳下地洞穿出去找到楼梯。由楼梯进入走廊（16），进入房间（17），由地板的洞往下扔手榴弹，炸掉下面的几座炮塔，跳下去与爱莉克斯会合。沿走廊（18）穿行到另一侧走廊（19）找楼梯下去，在控制室有几名队员加入。出大楼来到广场，这里爱莉克斯要破解电脑程序来开启大门，要保护她10分钟左右。开始时敌人会从各处楼顶出现，还有零星的飞锯，后期敌人由两侧的电磁门穿过来朝广场中央进攻，要尽量用手榴弹轰炸他们。破解完成后用重力枪打一下身后的堆心，大门轰然开启。跑过大门发现前方的桥梁切断，敌人的直升机也在空中出现。
跳入河道钻入一条地下通道，由竖井跳下去，用重力枪将门闩扔掉打开栅门，进入通道摧毁两只飞锯，在尽头将铁架下的两只铁桶打掉。站上铁架跳到管道上钻进通风道，越过前方的铁网栅栏跳到另一端，进房间杀掉三名士兵，跳到下一层绕到一侧，在窗口使用重力枪打开铁门。继续走是一条水道，僵尸和护卫队互相厮杀。先沿右侧通道走，跳到河道底部找通道进入厂房。爬上工厂车间的平台，到控制室将吊车移过来，乘吊车到达二层平台。往左爬竖梯跳到空中的管道，走到吊车的轨道上，再沿着它跳到三层平台。走到左端爬竖梯到第四层平台，走到对面跳下一层进入大门。
第十二章 跟着弗里曼
下楼梯在房间内找到队员加入，来到街道遭到楼顶狙击手的攻击。这时不用还击，利用街道两侧的角落藏身，然后用快跑（Shift）到下一个安全位置等能量恢复。在商店里找到一名女队员，得知巴尼在屋顶被狙击手困住不得脱身。跑入大楼在洗手间拿到补给，听到救命声跳入下面的水里找到受伤的队员，得知其他人在楼上。消灭出现的七只僵尸，由楼梯上去找到困在楼顶的巴尼，然后从箱子里拿到手榴弹，再确定两名狙击手的位置，朝窗户里扔手榴弹炸死他们。
和巴尼一起来到街道，他会操作电脑打开防御墙。由楼道穿出去来到庭院，这里遇到伏兵，用重力枪投掷油桶炸死他们。上阶梯进入大楼，由走廊的窗户看到博物馆的大楼，据巴尼所言，那幢大楼的顶部安装了抑制系统，要把它关掉才能穿过那里。来到房间被敌人发现，一道白光射过来能将人体融化，那就是博物馆顶的抑制武器。下楼梯穿出走廊来到户外街道（1），前方通道有电磁屏障，沿街道走到末端进入仓库（2），沿途要躲避白色光柱，沿着围栏一直跑到另一侧的房间（3），放出铁笼里的俘虏，带着他们穿过广场跑到博物馆大门的右侧屏障（4）前，用重力枪打掉插头。进入大楼后上楼梯，在走廊里遇到蓝色激光，上前触发它会出现一座炮塔，将手榴弹扔到炮塔里面炸掉它，巴尼上前用电脑打开大门。进入大厅（5）看到穹顶的直升机，大厅附近有几道电磁屏障，要关闭发生器才能消除它们。走到大厅另一侧的小门（6）前，门口有激光触发它，用手榴弹炸掉两座炮塔。找到楼梯间（7），上去在房间（8）释放战俘，炸掉两个炮塔进入控制室（9），用重力枪关闭发生器。过天桥（10）进入走廊，沿着它抵达仓库（11），进去后两侧大门同时关闭，走廊上出现敌人围攻，这时用重力枪透过墙洞在走廊上安置跳雷，然后守在墙洞射击跑动的敌人。在杀掉10余名后，大门被敌人割开，敌人由两侧攻进屋里，保护巴尼的安全，杀光敌人后穿过走廊到控制室（12）关闭第二台发生器。接下来走天桥（13），不用触发走廊尽头的炮塔，往右转进入房间（14），里面激光密布，不要触碰它们，利用设备（管道、铁架）跳过去。地上的跳雷用重力枪解除（不要引爆），跳到房间的另一侧按动开关将所有激光关闭，巴尼跑进来会合，进入控制室（15）关闭第三台发生器，这时所有的屏障解除，大厅的出口被打开。解除三只跳雷进入控制室，巴尼打开楼梯间的大门，三名队员加入队伍，巴尼离队。
来到楼顶杀掉一群敌兵，在门口旁拿到无限榴弹箱，这时空中出现直升机，用榴弹炮摧毁它，然后敌人的运输机会投下一队士兵，打开一道铁门冲过来。杀掉他们后沿铁门出去来到大楼另一侧，用开关放下天桥进入对面的建筑，找到炸坏的地板跳下去。回到博物馆前的广场，这里出现四只巨大的三角机甲怪，快速跑动跳入巨大的弹坑，穿出去跳到街道对面，在角落里有一只无限榴弹的箱子，使用榴弹炮将机甲怪全部炸毁，而后进入街道尽头的院落找到楼梯下去。穿过地下停车场上楼梯，沿着残垣断壁爬上去，在楼梯间找到另一只榴弹箱，消灭街上的机甲。由走廊的地板大洞跳下去，穿过地下停车场来到另一处废墟。据队员所说，这里的街道被机甲所占据，下面要做的是寻找制高点来压制它们。沿着断墙和柱梁一直往上冲，在平台上找到榴弹箱，将两只三脚机甲炸死后，踏着空中的铁梁走到废墟边缘，纵身跳落到街道上遇到阿狗。在杀死所有敌兵后，跳入阿狗打开的地下通道。
第十三章 我们的恩主
沿山洞往前进入昏暗的山谷，前方的路断掉了，这时往左沿峭壁一路跳过去，这里的道路异常险峻，稍有不慎便会摔得粉身碎骨。由水管跳到中央往复升降的石台上，再跳到相邻的通道。沿石径一直走，途中会有升降的石柱小心被砸到，往前看到有两排运输舱的空中轨道，其中有一排要进行电子灭菌。跑到另一侧进入航道相反的运输舱，接下来展开一段奇妙的旅程。
进入检查站后所有装备被自动清除，这时敌人来袭，迅速跑到角落拾起充满能量的重力枪，重力枪此刻威力增加，几乎可以吸附远处的敌人，摔出去使他们融化掉。前方一路没有岐路，一边听布林的唠叨和说教，一边应付沿途围截的敌兵，在尽头找到升降梯一直到达上层。前面的电磁屏障用重力枪吸引能量球来消除，找到升降机后会遇到大批飞锯和敌兵，按动开关等平台降下来。
升到顶层沿通道杀过去，在宽大的走廊遇到大批敌兵，快速往前冲并处理掉敌兵，然后出现一只巨大的三脚机甲，吸引两侧的能量球摧毁它。在左侧有道屏障，将光柱里的三只能量球吸出来可解除它，然后跳下去找到运输舱继续在城堡中穿行。
第十四章 暗能
运输舱最终被布林所捕获，在莫斯曼的带领下去见布林。在中央室里看到布林正在劝说伊莱放弃抵抗，并以爱莉克斯的性命要挟，这时莫斯曼突然倒戈解除了我们三人的束缚，布林见状不妙仓皇逃跑了。
跟着爱莉克斯进入升降梯，出升降梯进入一间实验室，结果布林又跑掉了。爱莉克斯打开了电梯，接下来要去破坏暗能聚变堆。在大厅听布林演说完，往右侧等柱子升起来跑过去，吸走左侧光柱中所有的能量球。由升降的柱子跳到对面的平台，绕到右侧再往中间的通道跳上柱顶，升上去后一直往上跳跃，最后到达顶层平台看到布林开始启动传送门。跑到平台的左侧，用重力枪吸附光柱里的能量球消灭两架直升机，然后朝传送门下方的白色光团发射能量球，直至将白光和传送机摧毁。布林在爆炸声中消失了。
任务终于完成了，神秘的G-man再次出现，看来说不定什么时候他还会交给我什么有趣的任务……
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